1098年,十字军面临着最大的危机,虽然他们已经避开了两线作战,但他们却被困在安条克的城墙之内,由于在第一次封锁中物资损耗严重,城市能够提供的食物和军事补给没有多少,并且,由于城堡在敌人手中,强大的城防也被大为削弱,远征军处于毁灭的边缘
十字军心怀一丝渺茫的希望,期盼已久的东罗马帝国援军可能会在阿莱克修斯的指挥下前来救援,然而,法兰克人不知道的是,阿莱克修斯皇帝只顾着收复小亚细亚海岸地区,当他得知法兰克人很可能已经战败时,皇帝选择了撤退到君士坦丁堡,再次生死关头,东罗马帝国背叛了十字军,希腊人再也未能彻底原谅,因为十字军遭到抛弃,他们只能独自面临凯尔波加的大军,他是一个野心勃勃的人,不满足于成为巴格达苏丹军队的主帅,他认为,在安条克对抗法兰克人的战争为自己带来了控制叙利亚的天赐良机,为了这场战争,他花费了整整六个月的时间精密部署
1098年6月,凯尔伯加小心谨慎又果断坚毅的发动了围攻,安条克第二次被围攻,它最初的策略是通过城堡和周围地区发动一次正面的主动突袭,在6月10日以后的四天中,他发动了一次又一次攻击,十字军拼命才保持对城市东部的控制权,战斗无休无止,由于未能正面突破法兰克人的防线,他转而采取迂回的方式,小规模战斗还在继续,但是从6月14日开始,穆斯林围攻者便集中精力围困城市,随着士兵的士气低落,很多人相信失败就要到来
6月14日,一小群法兰克人在一个名叫巴塞罗那的带领下,开始在圣彼得教堂进行挖掘,整个人生中安德鲁向他显灵,告诉他真十字架就在这里埋着,真十字架的出现鼓舞了拉丁人继续反抗的勇气,到了6月24日,情况仍然不能好转,于是派遣两名逝者和凯尔伯加谈判,条件是他们放弃这座城市,但是需要他们安全返回自己的国家,但是凯尔伯加拒绝了“你们只能自己杀出一条血路”
他们认识到他们唯一活命的办法就是正面交锋,于是他们准备开始自杀式对决,在那些最后的日子里,基督徒做了视死如归的准备,穆斯林的军队有着两个潜在的弱点,他们的部队主力谨慎的在北边扎营,围困城池的部队相对分散,而且薄弱,而且穆斯林军队对主将没有信心
1098年6月28日,十字军已经做好战斗的准备,他们越过奥龙特斯河,对平原上的穆斯林军队发起进攻,就是凯尔波加本应该派出主力部队增援,但是他犹豫了,不知道他到底怎么想的,等到法兰克人在厮杀中略占上风后,他在下令开始向前进军,他选择的时机糟糕透顶,法兰克人已经顶住了围困城池的穆斯林,发起了一系列猛烈反攻,基督徒的伤亡在增加,但是没有人后退,穆斯林的抵抗开始崩溃了,就在这个时候,屋子里的主力部队才刚刚抵达,由于威龙迅速击溃狼狈不堪的十字军,穆斯林逃跑了,正好逃到友军的阵营中,扰乱了军队阵型,其他的穆斯林军队为了避免受到严重损失,纷纷撤离战场
凯尔伯加的大军虽然只受到了一点损伤,然而,他还是被迫耻辱的撤退,丢弃了营地的财富,无光的逃亡美索不达米亚,战斗结束以后,安条克城堡中的穆斯林守军也投降了,这座大城市终于落入了基督人手中,安条克之战是一场令人震惊的胜利,十字军此前从未如此濒临覆灭,然而,出乎所有人意料,基督教世界取得了胜利,这一非凡成功的直接后果,是人们对十字军东征迅速划上圆满的句号,寄予了希望,但事实是,由于领袖们为叙利亚的战利品争吵不休,远征已经迷失了方向和动力,夏天的炎热引发了瘟疫,在这段时期里,远征陷入了对安条克未来归属的纠纷,这阻碍了所有针对巴勒斯坦的进一步行动,博希蒙德希望将这座城市据为己有,他声明是他的计策夺取了这座城市,6月3日黎明也是他的旗帜飘扬在城墙之上,现在他要求各位承认他的合法占有权,尽管他们此前曾向东罗马帝国皇帝许下过诺言,但是考虑到阿莱克修斯对他们的抛弃,多数人默许了,但是坦克伯雷不愿就此罢休,他宣称远征军对东罗马人的义务尚未履行,并且暗中派人去君士坦丁堡,恳求阿莱克修斯皇帝亲自对安条克提出主张,但是阿莱克修斯皇帝并不清楚十字军每个人的态度,加上自己亲手抛弃了他们,现在也不好意思出来说这座城市是自己的,所以并没有出面,事情陷入了僵局