北海道的寒夜，万籁俱寂，只有疗养院这间客房窗口透出的灯光，像一枚投入深海的孤星，倔强地亮着。工藤新一仿佛完全变了一个人。之前的颓废、沉寂、了无生趣被一种近乎燃烧的专注所取代。他像是沙漠中濒死的旅人突然看到了海市蜃楼，不顾一切地扑向那可能只是幻觉的希望之光。
桌面上铺满了泛黄的纸张、打印的资料、写满潦草公式和推论的笔记本。空气中弥漫着旧纸张、墨水以及他身上还未散尽的消毒水气味。他的脸色依旧苍白，甚至因为熬夜和过度思考而更添几分憔悴，眼下的乌青浓重得吓人，但那双湛蓝色的眼眸却亮得惊人，里面燃烧着沉寂太久后骤然复燃的火焰，以及一种破釜沉舟般的决绝。
腹部的旧伤和神经性的抽痛不时袭来，视力模糊也干扰着他的阅读。他不得不频繁地停下来，依靠在椅背上急促地喘息，吞下加大剂量的止痛药，或者用冰毛巾敷住刺痛的双眼。但每一次短暂的缓解后，他又会立刻重新扑回那堆如同天书般的资料中。
他的大脑以前所未有的速度运转着，超越身体的痛苦和极限。宫野志保那个孤零零的问号，像一把钥匙，不仅仅打开了他思维的枷锁，更点燃了他生存下去的全部意义。他不能被过去拖垮，不能被伤痛定义。她还在黑暗中前行，她需要他。这个认知，比任何药物都更能支撑他的意志。
他重新审视父亲工藤优作留下的每一份手稿、每一张草图、每一段看似漫不经心的注释。不再将它们视为无法挽回的过去，而是视为亟待破解的密码。他尝试着将父亲那些天马行空的小说构思、旅行笔记中的奇闻异事、甚至给母亲的情书中的暗语，与“潘多拉”、“遗产”、“圣杯”、“乌丸”这些关键词进行交叉比对和联想。
这是一个极其痛苦且耗神的过程。工藤优作的思维太过跳跃和隐晦，许多信息被故意打散和伪装。工藤新一常常在书桌前一坐就是几个小时，眉头紧锁，指尖无意识地敲击着桌面，陷入长时间的、雕塑般的沉思。
一次，他因为长时间维持一个姿势，腿部肌肉痉挛，剧痛让他从沉思中惊醒，冷汗瞬间浸透了衣衫。他咬着牙，艰难地按摩着痉挛的小腿，目光却依旧没有离开桌上那张画着奇怪螺旋符号的草图。
还有一次，他试图去够书架顶层的另一本父亲的早期作品集，脚下虚浮，差点从矮梯上摔下来，幸好及时扶住了书架，但腹部的伤口又是一阵撕裂般的疼痛，让他几乎喘不过气，眼前阵阵发黑。
负责照顾他的医护人员对此忧心忡忡，试图劝他休息，却都被他一种温和却异常坚定的态度拒绝了。他甚至开始更加配合复健治疗，但目的不再是为了“恢复普通人的生活”，而是为了获得足够支撑他进行高强度脑力劳动的体力。
“我必须…做点什么。”当赤井秀一再次来看他，看到他那副近乎自虐般的工作状态时，工藤新一只是抬起布满血丝的眼睛，沙哑地说了这么一句。
赤井秀一看着桌上那些密密麻麻的笔记和显然被反复翻阅、甚至有些页面被手指摩挲得边缘卷起的资料，绿眸中闪过一丝了然和不易察觉的复杂情绪。他没有再多问，只是留下了一些最新的、关于外界情报机构对类似“基因标记”或“生物共鸣”现象的研究简报（当然是高度加密且抹去来源的），并悄悄吩咐医护人员在不影响他健康的前提下，尽量满足他的需求。
时间在废寝忘食的破译中飞速流逝。工藤新一的身体依旧虚弱，但他的精神却如同绷紧的弓弦，越来越敏锐。
转折点发生在一个凌晨。他再次翻看到父亲一本早期推理小说《暗夜男爵》的海外初版手稿校样。这本书他小时候读过无数遍，讲述的是一个利用遗传病密码进行跨国复仇的故事。但这一次，他注意到了一些之前从未留意过的细节——在描写某个古老欧洲家族纹章的段落旁边，父亲用极细的铅笔写下了一串看似校对符号的标记。
鬼使神差地，他取来了宫野志保传回来的那张样本微观图放大打印件。他将那串奇怪的校对标记与样本核心的镜像对称序列进行比对…
心脏猛地一跳！
那不是校对符号！那是一种极其古老的、常用于纹章学密码的替代密码！而破译出来的结果，竟然与样本序列中一段看似冗余的“沉默片段”呈现出惊人的互补性！
父亲早就知道！他早就将线索隐藏在了自己最著名的小说里！用一种只有同样精通密码学、并且知晓“样本”存在的人才能解读的方式！
巨大的兴奋如同电流般席卷全身，暂时压过了所有的疼痛和疲惫！工藤新一的手指因激动而微微颤抖，他迅速循着这个思路，开始在父亲所有的著作、手稿、甚至采访记录中寻找类似的隐藏密码！
又是一个不眠之夜。当窗外泛起鱼肚白时，工藤新一面前的笔记本上，已经写满了破译出来的密码片段。它们零散、破碎，像是被打乱的拼图，但指向性越来越明确——
“遗产”并非一件具体的物品，而更像是一种…血脉中的隐性遗传标记，与某个古老的、追求生物进化的秘密结社有关。而“样本”，则是人工合成的、用于激发或追踪这种标记的“共鸣器”！
“圣杯”计划，指向的是一种利用这种共鸣，试图筛选、控制甚至“净化”特定基因谱系的疯狂野心，其历史可能远比乌丸莲耶的组织更为悠久！
而“潘多拉”…这个词反复与“代价”、“不可控”、“毁灭之盒”等词语关联出现。工藤优作似乎在警告，任何试图强行打开这个“潘多拉魔盒”的行为，都可能引发灾难性的后果。
最重要的发现是关于那“周期性加密信号”。工藤优作在一篇关于次声波与集体潜意识的科幻随笔草稿边缘，用密码写下了一个推测：【…共鸣强度并非恒定，受地磁异常、特定矿物辐射、甚至…大型强子对撞机实验周期干扰？需建立动态模型…】
地磁异常？特定矿物辐射？
工藤新一猛地站起身，因动作太快而一阵眩晕。他扑到电脑前，连接加密网络，开始疯狂检索全球范围内的地磁异常区分布图、稀有矿物分布图，以及…近期大型科研设施的活动日志！
他的大脑如同最高效的计算机，将破译出的密码信息、样本的数据特征、地理信息、科研数据…一切碎片进行交叉关联和拟合！
一天！又一天！他几乎不眠不休，完全沉浸在破解的狂热之中。医护人员送来的食物常常原封不动地放凉。他的身体以肉眼可见的速度消瘦下去，脸色苍白得透明，唯有那双眼睛，燃烧着令人心悸的光芒。
终于，在宫野志保发出那个问号后的第七天深夜。
工藤新一死死盯着屏幕上最终生成的、一个复杂无比的综合关联性动态模型。模型显示，样本发出的加密信号流，其微弱强度变化，与全球几个特定的、历史悠久且伴有特殊地质构造和矿物分布的区域的地磁波动周期，存在着高度疑似相关性！尤其是…位于瑞士和法国边境的…欧洲核子研究组织（CERN）所在区域！那里不仅有复杂的地质结构，其大型强子对撞机（LHC）运行时产生的巨大能量场，也可能对信号产生某种难以预估的调制或放大效应！
而其中一个相关性最高的点，恰好与父亲密码中提到的、某个与“乌丸”家族早期活动有关联的欧洲古老地区重合！
这就是答案吗？！ 宫野志保感受到的异常，是因为她身处FBI总部，而那里或许处于某个地磁波动或能量场的微弱影响边缘？或者，FBI总部附近，存在某种能引起样本共鸣的…东西？！
他猛地拿起那个只能接收信号的加密平板，心脏狂跳，几乎要撞破胸腔！他知道了！他可能破解了她那个问号背后的谜题！
但是…他无法回复！通道是单向的！
强烈的倾诉和沟通的欲望，与无法连接的物理限制，形成了巨大的焦灼，几乎要将他逼疯！他必须想办法告诉她！必须让她知道这些发现！这至关重要！
他在房间里焦躁地踱步，伤口因情绪激动而隐隐作痛，但他浑然不觉。突然，他的目光落在了桌角那份赤井秀一留下的、关于他身份恢复进度的简报上。简报末尾，附有一个下周即将召开的、关于国际生物安全合作框架的线上研讨会通知，主办方之一是FBI，与会者名单里…赫然有“宫野博士”的名字！
一个极其大胆、近乎疯狂的念头瞬间闯入他的脑海！
他立刻扑回电脑前，手指因激动和虚弱而剧烈颤抖，却以惊人的速度操作起来。他利用赤井秀一留给他的高级权限，悄然潜入疗养院那看似普通、实则连接着FBI内部保密网络的通讯系统底层。
他不能直接发送信息。但他可以…修改数据包。
他的目标是那个线上研讨会的官方预告页面。他利用极其短暂的系统刷新间隔，以微秒为单位，将页面背景图片中一片看似随机的、装饰性的科技感光点图案，用他刚刚破译出来的、代表地磁波动与样本信号关联性的核心算法代码序列进行了替换！
那串代码极其复杂晦涩，如同天书，混在背景图案里，几乎不可能被常人察觉。但他知道，如果宫野志保看到…如果她还有哪怕一丝留意官方信息的习惯…以她的智商和对样本的熟悉程度，一定能认出那是什么！一定能明白那是来自谁的回应！
这是一场豪赌。赌她能看到，赌她能看懂，赌FBI的网络监控人员会将其视为无意义的系统噪点或装饰图案而忽略！
完成这一切，他几乎虚脱般地瘫倒在椅子上，汗水浸透了衣衫，心脏仍在疯狂跳动。他能做的，只有这些了。剩下的，只有等待。
几天后，线上研讨会如期举行。
工藤新一早早地坐在电脑前，打开了会议直播页面。他的心脏跳得很快，手心全是冷汗。画面里，各个领域的专家头像依次出现。当宫野志保的头像出现在屏幕上时，他的呼吸几乎停滞了。
她看起来没什么变化，依旧是那样清冷的神情，穿着合体的职业装，金茶色的头发一丝不苟地挽起。她正在发言，语速平稳，逻辑清晰，阐述着关于生物制剂安全管控的技术性观点，完全是一副顶尖专家的模样。
工藤新一的目光死死盯着她的图像，试图从那双冰蓝色的眼眸里读出任何一丝异样。但她表现得无懈可击。
会议进行到一半，进入短暂的休息时间，屏幕切换到了那个官方预告页面，也就是被他篡改过的背景图。
工藤新一的心提到了嗓子眼！死死盯着屏幕！
一秒…两秒…三秒…
页面切换，会议继续。
似乎…什么都没有发生。
巨大的失落感如同冰水般浇下，让他浑身发冷。失败了吗？她没看到？或者看到了却没在意？还是…被FBI的安全系统发现了？
就在他几乎要被绝望淹没的时候——
屏幕右下角，那个原本用于显示与会者列表的角落，极其短暂地、几乎无法察觉地，闪烁了一下！
那不是系统故障的乱码！而是一个极其微小、瞬间出现又瞬间消失的、由像素点构成的图案——那是一个简化版的、来自阿笠博士早期发明的、只有他和她知道含义的“侦探徽章”图案！
虽然微小短暂得如同幻觉，但工藤新一绝对没有看错！
她看到了！ 她看懂了！ 并且她用这种同样隐晦到极致的方式，回应了他！
一股巨大的、难以言喻的狂喜和酸楚瞬间冲垮了工藤新一！他猛地捂住嘴，剧烈地咳嗽起来，眼泪却不受控制地涌出眼眶，混合着咳嗽声，是一种极度压抑后的情绪释放。
她收到了。 她明白了。 他们之间，那看似被斩断的连接，以另一种更加隐秘、更加危险的方式，重新建立了起来。
无声的对话，跨越了太平洋，在无数监控和防火墙的注视下，完成了第一次危险的交流。
希望如同微光，在绝对的寂静和黑暗中，再次顽强地亮起。
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