缺陷

寒武纪大爆发：寒武纪大爆发期间，地球上的无脊椎生物突然大量出现，但没有化石证据证明这些生命是从一个祖先演化而来。达尔文对此的解释未能完全令人满意，成为进化论中的一个未解之谜。‌

人类起源的争议：有人认为人类根本不是进化来的，而是外星人的产物或者人类的起源并不在地球。这些观点虽然缺乏科学证据支持，但反映了人们对人类起源的多样看法。‌

进化过程的随机性：进化过程中的变异被认为是随机的，这导致进化的方向和结果具有不确定性。这种随机性使得预测生物进化的具体路径变得非常困难。‌

环境适应性的问题：尽管人类和其他高级物种在地球上占据了主导地位，但它们并没有完全适应所有的环境。这引发了关于进化论是否能够完全解释生物多样性和复杂性的疑问。

当年达尔文提出《进化论》的时候，他对遗传与变异方面的研究并不多，当时人们争论遗传的成因不一，有人认为是液态混合，也有人认为遗传物质是粒子状态。

达尔文认为遗传和变异是随机的，基因突变可以在各个方向发生，或许这个理论能解释为何会突然出现直立人，为何猴子变成人却没有人猴的物种出现。

然而许多科学家分析认为演化一定是定向发生的。纵观地球整个物种演化历史，我们观测到生物从低等向高等演化，因此也不会存在高等向低等进化的可能性，就好比如猴子变成人，人却不会变回猴子。

二、最适者生存

按照达尔文《进化论》中“最适者生存”的说法，便是越高级的生物，应该具备越有生存优势的能力。我们人类是目前发现地球上拥有智慧文明的高级物种，成为地球的主宰，成为地球的主角，所有其他动物都低人一等，被称为野兽、牲口，甚至成为人类的食物。

不过仔细研究发现，所谓最适者生存，适应能力越强越高级的特种，灭绝的速度反而越快。举个例子，单细胞是地球上最古老的生物，存在地球上已经长达38亿年之久，然而它们一直好好地从来没有灭绝。

反观曾经是地球上的中等生物恐龙以及某些爬行卵生动物，即使存在了1亿6000万年最后仍然逃不过灭绝的悲剧。在人类出现以前，百分之九十九以上的哺乳动物就已经灭绝。

纵观人类历史，直立人300万年，智人短短的20万年，有记录的人类文明5000年，现代人类文明不过才几百年。除去人类物种我们发现越是高级的物种灭绝的速度反而越快。

三、生物内在进化

越是高级的物种，越进化晚集的物种，却又是越衰变的物种，也是最高生存劣势的物种。即越高级个体越衰弱、越不具备生存优势，这与达尔文《进化论》相悖的。

在地球上人类就是一个非常独特的物种存在着，如今人类拥有个体智慧、高度社会文明和科技水平，不过单单从人类个体而言是非常不符合进化认演变原则的，人类的强大是借助于自身的智慧与工具。

抛弃辅助工具，人类的反应速度比不上猫、狗，奔跑速度比不上狮子猎豹，体型比不过老虎大象，最连最基本的生存能力也不及其他小动物，夏天只要皮肤长期外露会被晒伤，冬天穿少点衣服会被冻死。人体结构长期立会造成腰痛，女性分娩非常困难……

太多太多的例子证明个体人类进化的不合理性，作为高等物种的人类，为何自身进化却是越来越衰弱了呢？

四、失落的国度：一个完全出乎我们意料的世界

撒迦利亚·西琴名著《地球编年史》，为我们打开了历史世界另一扇门，人类的文明从哪而来？地球物种真的是自然演变的吗？又或者是真的借助“外星文明”发展起来的？

回到上文介绍，智人就有如凭空出现一样，他们出现在地球上最不适合进化的冰河时期，比直立人晚了70万年，又比尼安德特人早了20万年。

智人的出现，包括同一时间内出现了当时的语言、文字、智慧文明等等，如今仍然是世纪难题无人能够解释清楚。而且按照人类文明的发展进度来说，现代文明发展简直就是火箭的速度即视感。