简介：神奇宝贝的世界出现了一个使用机器来吸取神奇宝贝的力量，从而能使用神奇宝贝绝招的人。他创建了一个抓捕神奇宝贝、以及对神奇宝贝进行各种实验的黑暗组织，企图将神奇宝贝淘汰，让人类完全统治世界。为此，神奇宝贝搜查官组织开始调查，势要将这个丧心病狂的黑暗组织完全摧毁。就在最强的神奇宝贝搜查官-度，顺利的打入了这个组织的内部，准备将他们一网打尽的时候，却被组织发现。好不容易逃脱的度，被一个奇怪的人救了一命，之后为了重新找到这个组织，一向对哥哥十分崇拜，一直想超越哥哥的度的妹妹开始着手调查了起来，在认识了小少年-小风之后，两个人为了拯救神奇宝贝、已经完成自己的心愿，开始了旅行……
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