尼比市

在小智和皮卡丘进行特训时，一个神秘的武士少年出现了。他本想用一把玩具刀来吓唬他们，但皮卡丘的铁尾技能出乎意料地将玩具刀一分为二。武士少年惊恐地解释说，他只是想进行神奇宝贝对战罢了，小智感到有些困惑

武士少年点头确认，解释说因为前面遇到的三个来自真新镇的训练家都非常强大，他想要找到第四位训练家来一雪前耻。小智听后，决定接受挑战。

狂暴的雷电攻击向了大甲，强大的电流使大甲无法继续战斗，最终晕倒在地，武士少年看到双方的差距只能无奈认输。

夜罗嘉使用了冲浪技能，召唤出如海啸般的巨浪，向大针蜂们席卷而去。大针蜂们惊慌失措，试图逃跑，但已经太迟了，许多大针蜂因此失去了战斗能力。夜罗嘉建议小智将这些失去战斗能力的大针蜂收服，以免它们对其他人造成伤害。小智同意了这个提议，于是大木博士的后院变得热闹起来，因为烈雀和大针蜂们开始频繁地发生冲突，导致大木博士经常遭受攻击，不是被啄就是被追打。

经过特训，独角虫和绿毛虫已经分别进化成了巴大蝴和大针蜂。而鲤鱼王则在默默地积累力量，等待一个完美的时机来完成它的进化。

在远处卖石头的武能注意到了小智的身影，他从这个少年的身上看到了自己年轻时的影子。武能沉思着，如果自己没有离开家，小刚应该也会像那位少年一样充满热情地去旅行吧。他开始考虑是否应该回到小刚的身边接替他的馆主位置，但小智并没有注意到武能的注视，继续前行，穿过树林，带着皮卡丘和夜罗嘉来到了神奇宝贝中心。

不过还没等小智找到座位大木博士就打来了电话