宣统三年(1911年)11月22日,重庆地区同盟会起义成功,建立蜀军政府。川南、川北、川东相继起义。革命党人发动民军包围成都,立宪派同赵尔丰以妥协谈判的方式实现成都和全川的独立。1月27日,赵尔丰宣告四川地方自治,大汉四川军政府成立。12月8日,蒲殿俊和朱庆澜在东校场阅兵,军队哗变,蒲和朱逃离成都,平乱后,由军官和士绅共推尹昌衡为都督,罗伦为副都督。大汉四川军政府成立后,四川出现了成、渝两个军政府并存。后经协商,双方于民国元年(1912年)2月2日协定:以成都为政治中心,设四川军政府,以成、渝两处都督分任正副都督;重庆为重镇,设镇抚府。四川宣告统一,尹昌衡出任四川军政府都督,张培爵任副都督,重庆镇抚府以夏之时为镇抚总长。尹昌衡即改编川军为5个师,武备生几乎控制了川军的各级领导权,形成了四川武备系。民国元年(1912年)夏,西藏暴乱危及四川,尹昌衡自请督师西征,平息了边境骚乱,驻军川西。民国二年(1913年)3月,二次革命爆发。6月,袁世凯解除尹昌衡川督职务,降任为川边经略使,胡景伊被任为四川都督。8月4日,熊克武在重庆成立讨袁军,建立四川讨袁军总司令部。随后两军在隆昌、泸州展开血战。8月中旬,张伯祥、张品山等由广汉起兵,占领绵阳。9月后,刘存厚部攻克资中、内江,王陵基部占领南充、定远、合川。黔军黄毓成部占领綦江,逼近重庆,滇军叶荃部进至宜宾,陕军张钫部后临夔州。熊克武于9月11日、12日被迫撤退。9月12日,黔军占领重庆,四川讨袁之役失败。民国四年(1915年)3月,袁世凯任命陈宧为四川巡按使。5月底,陈宧到达成都,后任四川将军,掌控全部川军及政务。陈宦上任后,借整编安置亲信,以削弱、控制川军。12月25日,蔡锷回到云南,发动护国战争,决定派滇军第1军入川。民国四年(1915年)12月10日至12日,护国军第1军第1梯团长刘云峰率2个支队为由昆明出发,赵又新、顾品珍两梯团为中路,于次年1月14日由昆明出发,董鸿勋率主力第3支队于1月10日先行,经毕节、永宁取泸州。第4梯团长戴戡为右路军,次年2月2日由贵阳出发,经松坎,攻占綦江,向重庆方向前进。民国五年(1916年)1月5日,袁世凯组织征滇军,入川进攻护国军,由第2路总司令张敬尧统一指挥入川的北洋军。1月16日,蔡锷所部刘云峰梯团抵达滇川接壤之新场。18日,占领四川高县西北之横江。19日,向叙府西南之安边进攻。21日占领叙府。袁军分反攻叙府被击退。27日,贵州护军使刘显世宣布贵州独立,并派出两路黔军协同云南护国军作战。31日,刘存厚在纳溪宣布加入护国军,自任护国川军总司令,迎蔡锷军入纳溪。2、3月间,滇、川护国军与北洋军在泸州、纳溪一线展开血战。护国军进入川南后,熊克武、但懋辛等组织四川义军,配合护国军作战。3月中下旬,护国军攻克纳溪、江安、围张敬尧于泸州城内。民国五年(1916年)5月8日,西南护国各省在广东肇庆推举唐继尧为军务院抚军长,滇军将势力扩展到了四川。5月22日,陈宧宣布四川独立并率部出川,蔡锷出任四川都督兼署民政长。8月底,蔡锷离川东渡日本治疗。蔡锷离川前,保举罗佩金暂署四川督军,罗佩金搜刮四川的财富,掠夺盐税,令四川人民负担入川滇、黔军的军饷,奉行“强滇弱川”政策,扩充入川滇军,压制川军。民国五年(1916年)冬,罗佩金召开编遣会议,裁减川军,激起川军5师长联名通电控诉。民国六年(1917年)3月,罗佩金以武力解散川军第4师,第2师师长刘存厚乘机联络川军各部共谋驱罗。4月18日,刘存厚率部围攻驻成都皇城罗佩金部,刘罗之战爆发。罗佩金被迫交出督印,于4月24日率部从成都退往简阳、自贡等地。滇黔联军在与川军作战中连连失利,退入川南。随后爆发刘存厚与戴戡的刘戴之战,黔军被赶出成都遭歼灭。8月下旬,川军第1、2、3师向简阳、资阳顾品珍部发动进攻,滇军于22日分两路撤至泸州和宜宾。11月22日,川军克泸州,28日攻占宜宾,刘存厚等部获胜。民国六年(1917年)8月25日至9月1日,孙中山在广州建立“中华民国军政府”,进入了“护法时期”。滇军唐继尧拒就元帅之职,将其中4个军开赴四川讨伐刘存厚,率滇黔联军攻川。12月3日,顾品珍率滇军第1军及耿金锡、李友勋2个旅攻克重庆,四川查办使吴光新撤出重庆,周道刚率残部败走永川、资中。12月8日,北洋政府任命刘存厚为四川督军。12月14日,滇黔联军占领泸州。12月21日,川军熊克武、但懋辛、石青阳等通电加入靖国联军,推举熊克武为四川靖国各军总司令,并推举唐继尧为滇川黔靖国联军总司令。民国七年(1918年)1月9日,熊克武召集川、滇、黔靖国各军将领在重庆开会,决定兵分三路,直取成都。2月20日,三省联军攻入成都,刘存厚等部退往陕南汉中地区。武备系日渐没落。2月25日,唐继尧任命熊克武为四川督军兼省长。唐继尧于9月在重庆召开川、滇、黔、鄂、豫五省联军会议,并就任“五省联军总司令”职。辛亥革命后,四川先后成为北洋、滇、黔军阀和四川各派军阀争夺和混战的中心。军阀混战,时间之长,次数之多,规模之大,祸害之重,为全国之最。