自1650年前后随着中国国内局势动荡，荷兰东印度公司一直关注事态发展是否会影响公司的贸易乃至在台湾的地位。
对此公司的最高决策机构十七人董事会曾决议，即便在太平时期也须维持1200人以上的士兵保护公司在台湾的财产但事实上并未执行。
1654年（随着国内平稳政治清明，中兴4年就有了收复台湾的念头，当郑成功被朱大奥收服以后就一直在福建厦门备战训练。
明朝出现了一个叛徒何斌在逃往厦门之后，大员地区便盛传国姓爷即将前来攻打的风声。
1月时大员商馆发现当地华商陆续将财产转移到大陆，同时前来贸易的华船急遽减少于是召集华商打听消息最后判断国姓爷将在8月底出兵。
大员长官揆一紧急备战要求各地加强侦察与武装，不准华人在普罗民遮城贩卖粮食所有华人头家仕绅软禁在热兰遮城中以免通敌。
田间未及收割的稻谷一律焚毁共焚毁8000袋之多，并造成华人伤亡揆一同时在3月10日向巴达维亚城的总督报告请求援军[。
1654年7月16日，巴达维亚总督派遣外号“固执约翰”的司令官范德兰（Jan van der Laan）率领12艘船只组成的舰队，载运1453人前往台湾。
总督并指示范德兰若国姓爷未如情报显示的来袭，则为了弥补财务损失舰队必须攻打澳门。
7月20日范德兰舰队中的11艘抵达大员，范德兰并不认为郑成功会前来攻打台湾，抵台不久便坚持要去攻打澳门，与大员方面官员爆发数次激烈争执。为此，大员评议会在1654年7月22日决议派遣使者前往厦门会见郑成功一探虚实。
8月下旬使者带着覆信回到大员，郑成功在信中表示善意并否认即将攻台但评议会根据种种迹象，判断郑成功攻台的危机并未解除。范德兰对此大为不满次日（1654年）8月14日率领两艘船只以及所有随行军官返回巴达维亚，若干船只被分头派往各地只留下4艘船和不到600名没有军官率领的士兵。这时大员地区的总兵力为1500人。
1654年9月6日即中兴四年荷兰驻台湾长官揆一签字投降，荷军交出了所有城堡、武器、物资，包括伤病员在内的约900名荷兰军民，最后由揆一率领乘船撤离台湾。
至此荷兰侵略者在台湾38年的殖民统治宣告结束，宝岛台湾又回到祖国的怀抱。
东印度公司离台揆一在投降协议书上签字。条约重点为：
双方停止一切敌对行动并忘记仇恨。 荷方将城堡、大炮、军用物资、商品和现金交给大明政府。
荷兰人可携带一切返回巴达维亚必须使用的食物、工具等物品。 荷兰士兵得以扬旗、鸣炮、荷枪、击鼓、列队上船。
大明应释放所有荷兰俘虏 东印度公司应释放所有中国人俘虏，9月9日，2000名荷兰人登上8艘荷兰船舰等候出航。
1654年9月9日揆一率领卢斯杜南号、唐堡号、安克文号、梅顿号、泰伯特号、纳尔登号、白鹭号和罗南号启程结束了荷兰在台湾38年的统治。
郑成功收复台湾的军事斗争，是中华民族反对外来侵略的成功尝试。通过这一斗争驱逐了荷兰殖民者维护了中华民族的利益，捍卫了中国主权和领土的完整因而具有极其重大的历史意义。
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