几十亿年前，希丝娜、莫尔斯夫妇与诸多科学家走遍各个星球，最后在地球找到了能让夸克族恢复自愈能力的最后一样材料。众人经过漫长的研究创造出了磐古，磐古的强大力量也使地球充满了生机。莫尔斯执意要拿走磐古，希丝娜不愿看到地球众生毁灭，与其经历多次大战，最终希丝娜贡献全部魔法力量击败莫尔斯。失去形体的希丝娜将由雷、风、土、火、水五元素创造的骑士之石交由精灵族保管，又将自己与磐古锁在自己创造的“萌学园”的地心实验室的生命之树中。莫尔斯等人则在大战后失去了踪迹。
一颗神奇的黑磁石落在「夸克」星球上，由于黑磁石拥有极其庞大的能量和不可思议的魔法能力，让原本爱好和平心地善良的「夸克」族人，分裂成两派族群--夸克族跟暗黑族，互相抢夺这颗灵石。
两族最后一战邪恶的暗黑族获胜，夸克星球永远沉入黑暗中。
为了不让暗黑势力继续扩大，也为了捍卫宇宙的和平，夸克族人将黑磁石藏在一本魔法书中，来到太阳系另一个星球--地球。
萌学园，传说成立的时间是在地球诞生的年代，隐藏在地球的大气层外，由夸克族人组成的魔法学校。萌学园的存在是个秘密，夸克族人也一直遵循前人的指示，隐藏魔法，隐藏萌学园。并由命定的五位代表正义的萌骑士：幻之星、炎之星、智之星、十之星、月之星持续守护地球的和平。
夸克族领袖希丝娜在地球成立了「萌学园」，除了暗中训练那些分布在地球各处的夸克族后代，更誓言齐力守护魔法书，对抗即将来袭的恐怖暗黑力量....
萌学园是一所由夸克族人组成的责任制魔法住宿学校，是和暗黑势力对抗的第一线，由魔法结界保护着，只有夸克人才能就读的学校。
历代萌学园校长的使命是负责寻找萌骑士，以及暗中保护分布地球各处的夸克族后代。
萌骑士的诞生非人为而是神圣的，只要萌学园的学生做出了萌骑士的精神，当时五星未齐聚的情况下，他就会成为萌骑士的一员。
只要集齐五星，以及奈亚公主，就可以通过使用萌骑士的驶卷使，召唤出可以消灭暗黑大帝的神圣武器——索雷伊圣剑。
暗黑族夸克族都来源于夸克星球。但在四百年前，由于灵石的降世，那两个族群产生不同理念，从而分裂，暗黑势力独立成群，暗黑族的黑魔法是以能量为基础，和夸克族的驶卷使大不相同。
最初的暗黑族有五大分支，暗黑大帝其中的一支，后来在213年前爆发了黑夸大战，暗黑族的其他的分支分别被封印，只有暗黑大帝被逼近萌学园的地下水道中，现在整个暗黑族以暗黑大帝为最高首领。
暗黑族虽然大多数是邪恶之辈，但也存在不少数拥有善良品质的好人。不过由于暗黑大具备极其强大的魔法能量和统治全宇宙的野心，很多暗黑族的人都愿意效忠于他，因此暗黑族和夸克族的误会颇深，至今为止依然还是独立的存在。
人类世界的某图书馆内
一个坐在图书馆的女孩正看着关于萌学园以及暗黑族和夸克族的书，她的旁边是萌学园的录取通知书，。其实早在几百年前夸克和暗黑它们俩族就是同根同源的一家人，此刻的她也算是她大概了解全了。
她拿起自己的转学手续看了看，眉毛不自觉的皱了皱。“这转学手续怎么送到人类世界了，不应该是送到我家的吗？真是奇怪。难道这转学通知书还有定位功能，算了，管他的呢？”
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