东京塔的观景台上，两个“工藤新一”并肩站着，俯瞰夜幕下的城市。一个穿着小学生的衣服，另一个穿着沾血的高中校服。
“他们到了。”“工藤新一”轻声说。
电梯门打开，琴酒走了出来，身后跟着伏特加和几个陌生的组织成员。
“哦，两个工藤新一。”琴酒的声音冷得像冰，“多么有趣的景象。”
柯南向前一步：“游戏结束了，琴酒。警方已经包围了这里，你无路可逃了。”
琴酒笑了：“你以为我们会在乎警察吗？我们今天来这里，是为了回收实验体。两个都是。”
“工藤新一”挡在柯南前面：“你不会得逞的。”
“有趣的台词，从一个人造品嘴里说出来。”琴酒嘲讽道，“你知道吗，你是我们最成功的作品。完美的身体，几乎完美的记忆复制...只可惜，最后那一点自我意识无法消除。”
“我不是你们的作品。”“工藤新一”坚定地说，“我是工藤新一，一个侦探。”
伏特加举起了枪，但琴酒抬手制止了他：“不，我要亲自处理。这是一个历史性的时刻——原型与复制品的对决。”
他掏出枪，但没有对准任何人：“我给你们一个选择。其中一个必须死，另一个可以活着离开。你们自己决定。”
柯南和“工藤新一”对视一眼。然后，几乎同时，他们朝不同的方向跑去。
“追！”琴酒命令道。
东京塔变成了迷宫。柯南利用自己对这里的熟悉程度，在楼梯和通道间穿梭。他故意留下线索，引导组织成员跟上自己，为另一个“自己”创造机会。
在一个观景台的死角，柯南被堵住了。琴酒慢慢走近，枪口对准了他。
“永别了，工藤新一。不，应该是江户川柯南。”琴酒的手指扣上扳机。
突然，一个足球从侧面飞来，精准地击中了琴酒的手腕，枪飞了出去。
“工藤新一”从阴影中走出来：“你忘了我吗，琴酒？”
“有趣的选择。”琴酒揉着手腕，“保护原型而牺牲自己？多么高尚的人造品。”
“我不是人造品！”“工藤新一”怒吼道，“我有记忆，有情感，有选择的能力！这就是人类！”
他冲向琴酒，两人扭打在一起。柯南想帮忙，但伏特加和其他组织成员已经围了上来。
就在这关键时刻，警笛声响起。目暮警官带领大批警察冲了进来。
“所有人不许动！放下武器！”
组织成员开始撤退，但琴酒死死抓住“工藤新一”：“你跟我走！”
“不！”柯南射出麻醉针，但琴酒躲开了。
就在这时，小兰的声音响起：“新一！”
她不知何时也来到了东京塔，看到两个新一，她愣住了。但下一秒，她做出了选择——她冲向与琴酒搏斗的那个“工藤新一”，一个空手道踢击，迫使琴酒松手。
“小兰...”“工藤新一”惊讶地看着她。
“我不知道发生了什么，但我知道你是新一。”小兰坚定地说，“至少有一部分是。”
琴酒见势不妙，从紧急出口逃走了。警方追了上去，但柯南知道，琴酒很可能再次逃脱。
观景台上只剩下柯南、“工藤新一”、小兰和随后赶来的灰原哀。
小兰看着他们两个，眼泪流了下来：“现在...谁能告诉我...到底发生了什么？”
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