渚薰的离去让真嗣陷入了无尽的痛苦与迷茫之中，他常常一个人坐在曾经与渚薰一起待过的地方，久久不语。
NERV并没有因为渚薰的死而停止运转，新的使徒威胁依然存在。碇源堂似乎对真嗣更加冷漠，只是不断地逼迫他驾驶EVA去战斗。
真嗣机械地执行着命令，他的眼神变得空洞，仿佛灵魂已经随着渚薰一同离去。但在一次与使徒的战斗中，真嗣的EVA突然出现了异常。
EVA的系统中似乎出现了一些奇怪的数据波动，真嗣在恍惚间仿佛听到了渚薰的声音。“真嗣，不要放弃。”那声音轻柔却坚定，真嗣猛地一惊，他环顾四周，却看不到渚薰的身影。
“渚薰？是你吗？”真嗣对着通讯器喊道，然而回应他的只有沉默。但那一瞬间的声音却让真嗣的心中重新燃起了一丝希望。
战斗结束后，真嗣开始疯狂地研究EVA的系统数据，他想要找到那个声音出现的原因。在一番努力后，他发现了一个隐藏在系统深处的神秘程序。
这个程序似乎与渚薰有着某种联系，真嗣小心翼翼地启动了它。突然，EVA的驾驶舱内亮起了一道奇异的光芒，光芒中，渚薰的身影若隐若现。
“渚薰！”真嗣激动地伸出手，想要抓住那虚幻的身影，“你还在吗？这是怎么回事？”渚薰的身影渐渐清晰了一些，他微笑着看着真嗣。
“真嗣，我把一部分意识留在了EVA的系统里，我知道你可能会需要我。”渚薰的声音从光芒中传来，虽然有些虚幻，但却充满了温暖。
真嗣的泪水再次涌出，“渚薰，我好想你。我以为我真的失去你了。”渚薰轻轻摇头，“你不会失去我的，真嗣。我们的羁绊比任何东西都要强大。”
从那以后，真嗣在每次驾驶EVA时都能与渚薰短暂地交流。渚薰会在战斗中给他指引，帮助他更好地应对使徒的攻击。
然而，碇源堂很快就察觉到了EVA系统的异常。他下令对EVA进行全面检查，试图找出真嗣与渚薰交流的秘密。
真嗣得知这个消息后非常焦急，他担心碇源堂会破坏渚薰留在EVA里的意识。他决定要保护渚薰，即使这意味着要与碇源堂对抗。
真嗣开始策划如何骗过碇源堂的检查。他利用自己在NERV的一些关系，偷偷地修改了EVA的检查程序，让那些异常数据不会被轻易发现。
在检查的那天，真嗣紧张地坐在EVA的驾驶舱里。碇源堂亲自监督着检查过程，他的眼神充满了怀疑。
“真嗣，EVA的系统为什么会有这么多异常波动？”碇源堂冷冷地问道。真嗣强装镇定，“我不知道，也许是战斗造成的一些故障吧。”
碇源堂紧紧盯着真嗣，似乎想要看穿他的谎言。但真嗣坚定地迎上他的目光，没有丝毫退缩。
检查持续了很久，最终，由于真嗣的巧妙安排，碇源堂并没有发现渚薰意识的真正所在。但他并没有完全相信真嗣的解释，决定对EVA进行更深入的研究。
真嗣知道危险并没有过去，他与渚薰商量着下一步的计划。“渚薰，我们不能让碇源堂发现你，不然……”真嗣的声音有些颤抖。
渚薰轻轻安慰他，“真嗣，别担心。我会想办法隐藏得更深。而且，我相信你，我们一定能找到应对碇源堂的方法。”
真嗣握紧拳头，“嗯！我们一起面对。”就在这时，新的使徒信号传来，NERV又一次进入了战斗准备状态。
真嗣驾驶着EVA出发了，渚薰的意识在系统中陪伴着他。这次的使徒比以往任何时候都要强大，战斗一开始就陷入了胶着状态。
“真嗣，集中精神，找到它的弱点。”渚薰的声音在真嗣耳边响起，真嗣深吸一口气。
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