我叫工藤新一，是一名高中名侦探，在陪小兰去游乐园做云霄飞车时，遇见了一件命案，后经过我的观察和分析后我找出了凶手，正当我和小兰要离开游乐园回家时，我无意撞破一名黑衣长发脑子的可疑行为。
我悄悄跟上去想要一探究竟，没有发现身后拿着棍子的另外一名黑衣男子，我被另外一名黑衣男子打昏了。
长发黑衣男子看着我露出了微笑，朝我嘴里喂了一颗药，然后就把我丢在了原地，潇洒离开了。
等我再次醒过来后，我发现我的身体表小了，我变成了小学生的模样。
走投无路的我找上了阿笠博士，阿笠博士看见我也非常的惊奇，他暂时找到了一件适合我这个身体穿的衣服，然后对我的身体进行全面的检查后，他也表示无能为力，但会给我研究解药。
就在这时，小兰突然来了，我绝对不能让他发现我就是工藤新一，我戴上阿笠博士给我的黑框眼镜，遮住我的眉眼，心里默念千万不要被发现。
我骗小兰我叫江户川柯南，是阿笠博士的远方侄子，因为一些原因暂时要阿笠博士家。
小兰相信，她微笑着说:“阿笠博士平时忙着做实验，肯定照顾不好你，要不然你去我家住吧”
我同意可
我住进了小兰的家中，看见了久违的毛利小五郎侦探，和他们住在一起的日子里总会出现各种稀奇古怪的命案，但我已经不是名侦探工藤新一了，我不能直白的指出谁到底是凶手，毕竟警察也不会相信一个小男孩的话。
于是我借用了阿笠博士给我的变声器，在必要的时候躲在不会被人发现的角落用麻醉枪射击毛利小五郎，再用变声器模仿他的声音讲出凶杀案的真相。
在追查凶杀案的过程中，我认识了当初给我喂药让我变成小孩的黑衣人组织中的雪莉，她也变成了小孩，在一个雨夜倒在了阿笠博士家，阿笠博士救助了她，她现在化名灰原哀。
她告诉我，我中的毒药名叫APTX4869，是又她发明的，只是现在她还没有研发出解药。
我为了早日得到解药变回原来的样子，我让阿笠博士收留了她，并让她和阿笠博士一起研究解药，我也会将她的真实身份进行保密。
我原本以为我们只会是合作朋友的关系，可时间久了，我感觉有一种不可抵抗的说不清的东西在影响着我和灰原哀。
我没有告诉小兰我就是她的青梅竹马工藤新一 ，因为在破案的过程中我发现了黑衣组织的踪迹，我担心他们会伤害小兰，所以一直都没有告诉小兰，我变小的真相。
在我找灰原哀要解药变回工藤新一去参加小兰的婚礼时，意外出了车祸。
在两辆车相撞的那一瞬间我的脑海浮现了很多东西。
脑海里有一个50多岁的大叔，拿着画笔在白纸上勾勒出了我的脸，他的画桌上铺满了画作，那些全部都是我过去侦破的凶杀案。
以及我跌入海底，灰原哀给我做人工呼吸电视上屏幕对我谩骂。
他们说:
名侦探柯南我从小学就开始看，73给设定的官配就是小兰，我现在已经出来上班，就为了等新兰有个美好的结局，结果73你告诉我你他妈画的是什么。
世纪之吻里面，小兰给工藤新一表白也只是亲了一下脸而已。
……
通过他们的话语，我才终于明白了原来我只是日本一个叫做青山xx的男人创造出来的虚拟动漫人物。
我所经历的事情全部都是他精心策划的。
大概小兰也不知道，早在我见到她的第一面，我就深深的爱上了她。
那位名叫73创世者明明也明白早在第一次见到小兰的时候，我就会爱上她。
她他明明明白却还是要利用创世者的身份操控我的意识和行为，让我和小兰之间产生误会，最后到达无可挽回的地步。
——我永远的失去了我的挚爱
我的眼前幻化出小兰微笑的模样。
我用仅有的力气张嘴想要告诉她，小兰我爱你，可我已经没有这个资格了，我让她等了太久了……
死亡也许是对我伤害她的惩罚吧。
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