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在一行人到达下一个道馆前，在途中上遇到了一只格斗神奇宝贝艾比郎。正当小智让皮卡丘与它进行对战时它的主人出现了并告诉它不要小瞧任何对手后艾比郎把皮卡丘打败了。这时人群中一位漂亮的女孩跑了过来劝艾比郎的主人回家但却被对方拒绝并走向别的地方，无奈的她向旁边的四人请求打败她父亲的艾比郎后并把小智等人带到家里说明情况。

在得知事情的经过后，小智和小刚报名参加了这场神奇宝贝格斗比赛。因为小霞和奈子没有格斗类的神奇宝贝所有抱着皮卡丘在场外看着，随着比赛逐渐进入尾声现场作战的选手也只有小智的火爆猴和对方的沙瓦郎。而艾比郎则在上一场对战中输给了沙瓦郎，但也因此使父女二人间的感情重归于好。场上因为沙瓦郎的踢技下火爆猴只能使用防守，但在小智的鼓励和指挥下成功击败沙瓦郎夺得冠军。临走时小智把火爆猴交给那位女孩的父亲，至于原因吗当然是小智看到了火爆猴对格斗的喜爱并希望它能坚持下去。

告别火爆猴后一行人继续出发来到了一个看起来有些破败的城市黑云市，风吹过海面都会带来一股臭泥的味道影响人们的心情。正当大家在寻找附近的居民时，奈子和小智的皮卡丘突然晕倒在地上脸颊时不时发出细微的电流。小智正想去抱时奈子及时发现状况并将绝缘手套给他，随后众人一起跑向神奇宝贝中心。

“皮卡丘在坚持一下，马上就到中心了。”抱着皮卡丘跑的奈子在转弯时不知道被什么给绊倒了，小霞见到后立马跑到奈子身边查看好在奈子和皮卡丘都没有受伤。正当她们想跟上前面俩人时地上的那个黑影发出了虚弱的声音“百变~”，听到声音的奈子也顾不上那么多直接用精灵球将它收服。之后俩人带着皮卡丘跟上了前面的他们来到神奇宝贝中心，将两只皮卡丘和装有陌生神奇宝贝的精灵球交给乔伊小姐后众人才放下心来。

可这时神奇宝贝中心突然停电，乔伊小姐从急诊室里跑出来跟大家里面的情况后。四人决定去发电站看看情况，“皮~皮卡~”还在生病的两只皮卡丘表示自己也要去。“放心会带着你们去的，但前提是不可以强撑着身体去释放技能。”奈子说完后它们同时点头于是大家带着两只皮卡丘去往发电站。

从君莎小姐那知道发电站的位置后，大家进入发电站内部可走了半天一个人都没有看见。“皮~皮卡~”听到皮卡丘的声音后众人往那一看便看到在两只皮卡丘身边飞来飞去的小磁怪，正当大家猜测是不是小磁怪引发的停电时。奈子听到身后传来异样的动静转过身便看到了有一大群臭泥正在看着他们。随后发电站里众人在前面跑后面一群臭泥在追，在拐角处的时候大家遇到了这里的工作人员并跟着他们来到安全的房间里。

在工作人员口中得知是臭泥引发的断电后，房间里的大门也被臭泥们破开并走了进来。“皮卡~丘~”两只皮卡丘跑到众人前面释放电击，虽然皮卡丘们的电击成功将它们吓退但很快又聚集在一起往这边靠近。这时从外面飞进来一群小磁怪和三合一磁怪成功打退了臭泥们，发电站因此恢复电力而小智也成功收服了一只臭臭泥。等大家回到神奇宝贝中心后奈子从乔伊手中接过精灵球将百变怪放了出来，在问道要不要跟她一起离开这里时百变怪欣然同意。