这里是一座陌生的城市，宝可梦们和人类一起生活，而一群神秘组织打破了这样的安宁，城中弥漫着硝烟，许多宝可梦分分被抓，人们四处逃窜。一位少年带着他的弟弟妹妹往城市中央的城堡跑去，他们是这里王族。
踏进城堡大门，只见地上躺着无数卫兵，他们继续前进，来到大殿里。
“父王！母后！”
三个孩子看见自己的父母倒在血泊中，他们上前推了推，毫无动静，恐惧感深入心中。
“咳咳！”倒下男人突然咳出声，三个孩子立马上前查看。
“父王，你没事！”
“孩子们，咳咳，快走”说着，男人掏出一颗晶莹剔透的金色球形宝石递给了年纪最大的孩子“这颗麒麟圣石你们拿着，快走”
“不，要走一起走”三个孩子抽泣着
男人不打算和他们多说，硬抗着重伤的身体，拉着孩子们到一个角落打开一个隐藏门，随后把孩子们推了进去：“不要任性，记住，你们是魔灵一族最后的希望”说完，殿外就传来一阵笑声，男人迅速关闭了通道。
“你果然还没死”三个黑衣人带着一群头上带着奇怪装置的诅咒娃娃闯了进来。
“快把麒麟圣石交出来，我们老大或许可以赏你一个痛快的死法。”
“咳咳，光明种子都被你们抢走了，威斯克，你太贪婪了”
“哦，那好吧我不要了”说着，中间的黑衣人竟伸出爪子结束了男人的生命。
“父王！”
“嗯？老大，这墙后面有人”
一看行踪暴露，三个孩子开始逃亡，就快到出口时，一道幻象光打了过来，出口是在一处悬崖附近，因为幻象光的冲击，把最小的妹妹弹下了悬崖，好在她抓住了一块岩石。
“莱尔，我来拉你上来”老二想去救妹妹，却被哥哥拦了下来。
“莱恩，你带着麒麟圣石走，快，否则我们都走不了”说着把弟弟推开，自己卧下身子准备把妹妹拉上来，这时又一道幻象光打了过来，兄妹俩一起掉了下去。
“还剩一个，快追”
莱恩来不及伤心，起身继续跑。
“想跑去哪？”大殿上的一个黑衣人突然跳出来挡住了去路，身后又跟着一另一个黑衣人以及一些诅咒娃娃，莱恩掏出精灵球准备殊死一搏。
“出来吧，卡茨”
“英卡洛斯，使用真空千烈破”
突然飞出来的两道刀刃击退了黑衣人，开出了一条路。莱恩转头望去，一个男人带着一只螳螂宝可梦前来支援。
“您是…贾斯汀先生？”
“等会儿再说，跟我来。”
男人带着他们逃到了一个山洞里，山洞中别有洞天，这里竟藏着一间实验室。莱恩的目光锁定在了一个巨大的圆圈上。
“这是星际之门？”
在这时，男人突然蹲下身，双手搭在莱恩的双肩之上，语重心长的说道：“莱恩你听好了，等会儿我启动星际之门把你和卡茨传送到凡域，到了凡域，去找一个叫小智的少年，年龄跟你差不多，他会帮助你。”
“那您怎么办？”
“别担心我，我可是神域的冠军，记得吗？”
谈话之际，追兵已经到了洞口，贾斯汀把莱恩和卡茨送走了以后，引爆了实验室。
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镜头一转，在一艘行驶的船的甲板上突然发生了一场威力不算大也不算小的爆炸。
火箭队好讨厌的感觉！
果然翁“so nai si”
小智这些家伙还真是学不乖唉！（转正了自己被爆炸吹歪的帽子）
皮卡丘pi ka （点点头）
小智望着飞远的火箭队，无意间看到了一座岛，脸上迅速洋溢起笑容。
小智皮卡丘，快看，是美乐美乐岛
皮卡丘“pi ka qiu”
小智原本在关都地区独自旅行，追寻着梦想，在阿罗拉的库库伊博士联系到小智，希望能邀请冠军前去参加皇家对战，热爱宝可梦对战的小智当然不会错过这个机会，立刻登上了前往阿罗拉的船只。
登上美乐美乐岛后，小智第一件事就是往库库伊博士家跑去。
小智“库库伊博士，芭内特博士，是我，小智”
皮卡丘“pi ka pi ka”
可喊了半天也没任何回应，没办法小智只好拿出之前库库伊博士给他的钥匙，却发现门没锁，如此奇怪的状况让小智进入了警惕状态。
小智皮卡丘，我们小心点，这屋子好像进小偷了（小声）
皮卡丘pi ka（点点头）
小智蹑手蹑脚的走进屋子，开始寻找可疑的东西，皮卡丘似乎闻到了什么熟悉的味道，顿时放下了警惕。
这时小智隐约感觉后面有人在向自己靠近，小智装作没发现，等待着目标再靠近。
小智就是现在皮卡丘，十万伏特
皮卡丘“pi ka……qiu”
小智得意洋洋的转过头，顿时傻眼了，只看见一个坐在地上头发翘起来的蓝发少女和一只失去战斗能力的波加曼。
小智小……小光？
皮卡丘pi ka qiu?
小光好麻哦，我的头发，小智，我只是想捉弄你一下，有必要对我下手这么重吗？（小光被电的全身麻痹不能动弹）
小智抱歉抱歉，我还以为是小偷呢，话说小光你怎么会在这？
小光“我现在在这里上学哦，来帮库库伊博士拿精灵球，刚好碰见你来了，就想着捉弄你一下，却没想到反而被你收拾了”
波加曼bo jia bo jia(波加曼醒了过来，对着皮卡丘就是一顿数落)
小光想试着站起来，但电击的效果迟迟未退，站起来也东倒西歪的，站都站不稳，别说走了，没办法，小智决定帮帮小光。
小光唉唉？小智你干嘛？
此时的小光被小智公主抱在怀里，满脸通红的望着眼前的男孩。
小智你站起来都是问题，怎么去宝可梦学校？我只能这样咯，走吧，皮卡丘波加曼。
说完，抱着女孩就往屋外走，两只小跟班也随之跟了上去，而怀里的小光脸越来越红。
小光“那个……小智，你知不知道男孩子这样抱着女孩子走会让女孩子很害羞？”
小智“为什么？”
小光当然是……算了（小光无奈的叹叹气）笨蛋小智。
眼看离学校越来越近，小光心里也越来越慌，她非常害怕被别人撞见他们如此亲密的模样。
小光“好了小智，我可以自己走了，快放我下来”
听到小光的吩咐，小智也很听话的放下女孩。其实，如果不是快到学校了，小光还挺想继续赖在小智身上，下来后的小光第一件事就是检查自己的头发，还好已经恢复，一抬头脸又瞬间变红，此时的她离小智的脸只有几厘米的距离。
小智“你怎么了？脸这么红是不是生病了？”
小光没……没……事（慌慌张张地退后几步）
波加曼看见此情形，脸上露出了邪恶的笑容，对着身边的皮卡丘交谈起来。
波加曼“bo jia bo jia bojia（你再对小光用一次十万伏特）”
#皮卡丘“pika?”皮卡丘摇摇头，表示不想恶作剧
波加曼“bojiajia bojiabojia（不是恶作剧，是帮你家小智解决人生大事）”
皮卡丘听着似乎很有道理，但故意伤害同伴的事他还是很抗拒。
到了教室，小光兴致冲冲的把精灵球交给库库伊博士后，又跑回到门口。
小光看看谁来了，蒋蒋！冠军驾到！
说着，一把将躲在门后的小智拽了出来，小智的出现，让学校里响彻了一番尖叫，这时，小智发现在这些老同学中间，还有其他几张熟悉的面孔。
小智“小遥，莎莉娜，还有建吾，难道你们都在这儿学习吗？”
小遥前些日子美乐美乐岛举行了一场华丽大赛（就是超世代篇末尾的那种非正式的华丽大赛），我们几个就顺便来参赛的同时好好度个假，结果就被宝可梦学校吸引，当上了这里的学生。
托戈德玛尔tuo gw tuo ge
马玛内的托戈德玛尔突然跳出来，黏上了皮卡丘，这让原本待在精灵球里卷卷耳感受到了威胁，于是自己跑出来分开它们，又换自己黏上去。
托戈德玛尔tuo ge（生气）
卷卷耳mi mi（生气）
大战一触即发，小光和马玛内赶忙将两只收进球里，避免了一场混乱。
健悟小智（嘴角微微上扬）明天的皇家对战我也是参赛选手哦，你可得认真点儿
小智健悟也参加？好，上次输给你，这次可不会了
健悟交代完，看了小光一眼，小光知道那眼神是什么意思，她明白建吾的心意，但自己对健悟完全没有感觉，也不知道要怎么回应他。
镜头一转，大伙儿来到户外进行对战训练，有冠军亲自教导，学生们都斗志满满。
小智皮卡丘，铁尾
就在皮卡丘跳起来用铁尾发起进攻时，一只机械手抓住了它。
小智“怎么了？”
武藏“既然你诚心诚意的发问了”
小次郎“我们就大发慈悲告诉你”
武藏为了防止世界……
小智“火箭队，快把皮卡丘还我”
武藏喂！小鬼头，有没有点礼貌？好歹让人把话说完啊！（武藏很是不爽，准备跳下气球收拾他）
果然翁so nai si（点点头）
.莎莉娜“你们突然冒出来捣乱，也懂什么叫礼貌？”
武藏“哟！我还以为说话的是谁呢！这不是卡洛斯地区那个小鬼头的小迷妹嘛！”
.莎莉娜唉？（脸红）
莎莉娜看看周围，除了小智还在盯着火箭队以外，其他人都看向了自己，瞬间觉得好羞耻，好想找个洞钻进去。
这时，地面突然摇晃起来，原本明亮的天空顿时暗了下来。
小次郎怎么回事啊？不会是因为我们干坏事遭天谴了吧（害怕）
刚说完，就被武藏揍了一拳
武藏瞎说什么呢
地震停了下来，众人还在一脸懵的同时，莉莉艾让大伙儿看向天空，只见空中开了一个洞。
卡奇“是究极之洞吗？”
格拉吉欧不，不太像
从洞中跑出了一个蓝色光球，径直朝他们飞来。
小次郎“朝我们砸来了，喵喵，快改变气球方向”
喵喵“喵正在做啊！来不及了，快跳伞啊喵”
一瞬间火箭队的气球被烧成了灰烬，皮卡丘也趁机挣脱束缚，跑回了主人身边。
小智快躲开
光球砸了下来，地面被砸出一个巨大的坑洞，而天空也恢复了之前的明亮，众人看向坑洞中，里面的场景让所有人为之惊叹。
小遥是个人？
莉莉艾还有一只从没见过的宝可梦
武藏果然是大难不死，必有后福啊！小次郎，喵喵，我们把这只没见过的宝可梦抓回去，板木老大一定会给我们升职加薪
“好棒的感觉！”小次郎和喵喵异口同声地喊。
说干就干，火箭队趁着坑洞中的一人一宝可梦处在昏迷中，加快速度妄想抢走目标，还未靠近，昏迷中的一人一宝可梦睁开了双眼，起身站着，火箭队感受到一股浓浓的不详气息，随之停下脚步，只见站起来的他们眼睛散发着红光，全身透露着一股黑气，让人不禁打起了哆嗦。
武藏我看我们还是快跑吧（害怕地颤抖）
喵喵喵同意（害怕）
果然翁so nai si
说着转身准备开溜，但人家并不给他们这个机会，那只宝可梦大吼一声后，双手拍了下地面，此时土块就像有生命一样飞过去牢牢困住他们。
小次郎我们要被活埋了！
好在土块还给他们露了个脑袋可以呼吸，解决完火箭队，他们转身看向小智等人，就在准备再次攻击时，他们脖子上的吊坠同时发出光芒驱散了黑气，一人一宝可梦又再次昏迷过去。
小智缓缓走上前，看见地上的一颗晶莹剔透的球形宝石。
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路人1看，那个被国王收养的小孩和他的宝可梦都是诅咒之子，会给我们带来厄运的
·莱恩不，我们不是
路人2来了，快走，离他们远点，我可不想沾上霉气。
·莱恩（莱恩睁开眼睛，喘着粗气）是梦啊！
他环顾四周，发现自己躺在一张床上，房间有点像病房。
·莱恩卡茨？
他慌忙寻找着自己的宝可梦，直到看见卡茨在自己枕边睡着才放下心来。
库库伊博士你醒了？
听见声音，莱恩迅速警惕起来，目不转睛地望着眼前陌生的男人。
库库伊博士别紧张，我不会对你怎么样的，你肚子饿了吧，我带了些新鲜的树果
库库伊博士对这个充满谜团的孩子很是好奇，但为了让他放松下来，库库伊并没为难他，脸上保持着笑容，莱恩的警惕心也渐渐放松下来。
库库伊博士我叫库库伊，是阿罗拉的宝可梦学校的老师
·莱恩阿罗拉？这么说我已经来到凡域了？
库库伊博士凡域？
·莱恩不，没什么（拿起一颗树果塞进嘴里）
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